HERSCHLAG, D.: шукати на сайті Z-Library

Lipfert, Jan, Doniach, Sebastian, Das, Rhiju, Herschlag, Daniel

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.04 MB

english, 2011

Understanding Nucleic Acid–Ion Interactions

Журнал:

Kraut, Daniel A., Carroll, Kate S., Herschlag, Daniel

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.58 MB

english, 2014

C HALLENGESIN E NZYME M ECHANISMAND E NERGETICS

Журнал:

Gregory Herschlag, Laura Miller

Рік:

2003

Мова:

english

Файл:

PDF, 769 KB

english, 2003

Programmable assembly of pressure sensors using pattern-forming bacteria

Cao, Yangxiaolu, Feng, Yaying, Ryser, Marc D, Zhu, Kui, Herschlag, Gregory, Cao, Changyong, Marusak, Katherine, Zauscher, Stefan, You, Lingchong

Журнал:

Nature Biotechnology

Рік:

2017

Мова:

english

Файл:

PDF, 3.80 MB

english, 2017

Reynolds number limits for jet propulsion: A numerical study of simplified jellyfish

Журнал:

Journal of Theoretical Biology

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 914 KB

english, 2011

Semiautomated and rapid quantification of nucleic acid footprinting and structure mapping experiments

Laederach, Alain, Das, Rhiju, Vicens, Quentin, Pearlman, Samuel M, Brenowitz, Michael, Herschlag, Daniel, Altman, Russ B

Журнал:

Nature Protocols

Рік:

2008

Мова:

english

Файл:

PDF, 733 KB

english, 2008

Isotope-Edited FTIR of Alkaline Phosphatase Resolves Paradoxical Ligand Binding Properties and Suggests a Role for Ground-State Destabilization

Andrews, Logan D., Deng, Hua, Herschlag, Daniel

Журнал:

Journal of the American Chemical Society

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 3.09 MB

english, 2011

MECHANISTIC ASPECTS OF ENZYMATIC CATALYSIS:Lessons from Comparison of RNA and Protein Enzymes 0

Narlikar, Geeta J., Herschlag, Daniel

Журнал:

Zeqiraj, Elton, Filippi, Beatrice Maria, Goldie, Simon, Navratilova, Iva, Boudeau, Jérôme, Deak, Maria, Alessi, Dario R., van Aalten, Daan M. F., Herschlag, Daniel

Рік:

1997

Мова:

english

Файл:

PDF, 360 KB

english, 1997

ATP and MO25α Regulate the Conformational State of the STRADα Pseudokinase and Activation of the LKB1 Tumour Suppressor

Журнал:

PLoS Biology

Рік:

2009

Мова:

english

Файл:

PDF, 3.22 MB

english, 2009

Protein enhancement of hammerhead ribozyme catalysis

Tsuchihashi, Z, Khosla, M, Herschlag, D

Журнал:

Science

Рік:

1993

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.27 MB

english, 1993

An Exact Solution for Stokes Flow in a Channel with Arbitrarily Large Wall Permeability

Herschlag, G., Liu, J.-G., Layton, A. T.

Журнал:

SIAM Journal on Applied Mathematics

Рік:

2015

Файл:

PDF, 852 KB

2015

An Exact Solution for Stokes Flow in a Channel with Arbitrarily Large Wall Permeability

Herschlag, G., Liu, J.-G., Layton, A. T.

Журнал:

SIAM Journal on Applied Mathematics

Рік:

2015

Мова:

english

Файл:

PDF, 852 KB

english, 2015

From sequence to nanostructure: a critical base pair in RNA k-turns that confers folding and structural characteristics, and correlates with biological function

Huang, Lin, Shi, Xuesong, Herschlag, Daniel, Lilley, David

Журнал:

Acta Crystallographica Section A Foundations and Advances

Рік:

2015

Файл:

PDF, 382 KB

2015

High-Throughput Investigation of Diverse Junction Elements in RNA Tertiary Folding

Denny, Sarah Knight, Bisaria, Namita, Yesselman, Joseph David, Das, Rhiju, Herschlag, Daniel, Greenleaf, William James

Журнал:

Cell

Рік:

2018

Мова:

english

Файл:

PDF, 9.33 MB

english, 2018

Increasing the length of poly-pyrimidine bulges broadens RNA conformational ensembles with minimal impact on stacking energetics

Merriman, Dawn K, Yuan, Jiayi, Shi, Honglue, Majumdar, Ananya, Herschlag, Daniel, Al-Hashimi, Hashim M

Журнал:

RNA

Рік:

2018

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.14 MB

english, 2018

Determination of the conformational ensemble of the TAR RNA by X-ray scattering interferometry

Shi, Xuesong, Walker, Peter, Harbury, Pehr B., Herschlag, Daniel

Журнал:

Nucleic Acids Research

Рік:

2017

Мова:

english

Файл:

PDF, 4.11 MB

english, 2017

An RNA chaperone activity of non-specific RNA binding proteins in hammerhead ribozyme catalysis.

Herschlag, D., Khosla, M., Tsuchihashi, Z., Karpel, R.L.

Журнал:

The EMBO Journal

Рік:

1994

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.66 MB

english, 1994

The roles of structural dynamics in the cellular functions of RNAs

Ganser, Laura R., Kelly, Megan L., Herschlag, Daniel, Al-Hashimi, Hashim M.

Журнал:

Nature Reviews Molecular Cell Biology

Рік:

2019

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.06 MB

english, 2019

Quantifying Gerrymandering in North Carolina

Herschlag, Gregory, Kang, Han Sung, Luo, Justin, Graves, Christy Vaughn, Bangia, Sachet, Ravier, Robert, Mattingly, Jonathan C.

Журнал:

Statistics and Public Policy

Рік:

2020

Файл:

PDF, 2.38 MB

2020

Structure and Function Converge To Identify a Hydrogen Bond in a Group I Ribozyme Active Site

Marcello Forconi, Raghuvir N. Sengupta, Mao-Chin Liu, Alan C. Sartorelli, Joseph A. Piccirilli, Daniel Herschlag

Журнал:

Angewandte Chemie

Рік:

2009

Мова:

english

Файл:

PDF, 671 KB

english, 2009

Structure and Function Converge To Identify a Hydrogen Bond in a Group I Ribozyme Active Site

Marcello Forconi, Raghuvir N. Sengupta, Mao-Chin Liu, Alan C. Sartorelli, Joseph A. Piccirilli, Daniel Herschlag

Журнал:

Angewandte Chemie International Edition

Рік:

2009

Мова:

english

Файл:

PDF, 671 KB

english, 2009

The role of induced fit and conformational changes of enzymes in specificity and catalysis

Daniel Herschlag

Журнал:

Bioorganic Chemistry

Рік:

1988

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.50 MB

english, 1988

Mapping the transition state for ATP hydrolysis: implications for enzymatic catalysis

Suzanne J. Admiraal, Daniel Herschlag

Журнал:

Carol A Fierke, Dan Herschlag

Рік:

1995

Мова:

english

Файл:

PDF, 3.30 MB

english, 1995

The wide reach of enzymology: from bioorganic chemistry to chemical biology and beyond Mechanisms

Журнал:

Current Opinion in Chemical Biology

Рік:

2006

Мова:

english

Файл:

PDF, 80 KB

english, 2006

The wide reach of enzymology: from bioorganic chemistry to chemical biology and beyond: [Current Opinion in Chemical Biology 2006, 10:453-454]

Carol A Fierke, Dan Herschlag

Журнал:

Current Opinion in Chemical Biology

Рік:

2007

Файл:

PDF, 57 KB

2007

A repulsive field: advances in the electrostatics of the ion atmosphere

Vincent B Chu, Yu Bai, Jan Lipfert, Daniel Herschlag, Sebastian Doniach

Журнал:

Current Opinion in Chemical Biology

Рік:

2008

Мова:

english

Файл:

PDF, 707 KB

english, 2008

The role of the cleavage site 2′-hydroxyl in the Tetrahymena group I ribozyme reaction

Aiichiro Yoshida, Shu-ou Shan, Daniel Herschlag, Joseph A Piccirilli

Журнал:

Patrick J O'Brien, Daniel Herschlag

Рік:

2000

Мова:

english

Файл:

PDF, 288 KB

english, 2000

Catalytic promiscuity and the evolution of new enzymatic activities

Журнал:

Herschlag, Daniel, Cech, Thomas R.

Рік:

1999

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.69 MB

english, 1999

10.1038/26864

Herschlag, Daniel

Журнал:

Nature

Рік:

1998

Мова:

english

Файл:

PDF, 165 KB

english, 1998

DNA cleavage catalysed by the ribozyme from Tetrahymena

Журнал:

Nature

Рік:

1990

Файл:

PDF, 723 KB

1990

10.1038/75132

Herschlag, Daniel, Russell, Rick, Millett, Ian S., Doniach, Sebastian

Журнал:

Natural Structural Biology

Рік:

2000

Мова:

english

Файл:

PDF, 387 KB

english, 2000

Multiple native states reveal persistent ruggedness of an RNA folding landscape

Solomatin, Sergey V., Greenfeld, Max, Chu, Steven, Herschlag, Daniel

Журнал:

Nature

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 460 KB

english, 2010

The far reaches of enzymology

Zalatan, Jesse G, Herschlag, Daniel

Журнал:

Nature Chemical Biology

Рік:

2009

Мова:

english

Файл:

PDF, 332 KB

english, 2009

Isolation of a local tertiary folding transition in the context of a globally folded RNA

Narlikar, Geeta J., Herschlag, Daniel

Журнал:

Natural Structural Biology

Рік:

1996

Файл:

PDF, 1.02 MB

1996

Implications of molecular heterogeneity for the cooperativity of biological macromolecules

Solomatin, Sergey V, Greenfeld, Max, Herschlag, Daniel

Журнал:

Nature Structural and Molecular Biology

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 598 KB

english, 2011

Pyrophosphate formation for acetyl phosphate and orthophosphate anions in concentrated aqueous salt solutions does not provide evidence for a metaphosphate intermediate

Herschlag, Daniel., Jencks, William P.

Журнал:

Journal of the American Chemical Society

Рік:

1986

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.22 MB

english, 1986

Nucleophiles of high reactivity in phosphoryl transfer reactions: .alpha.-effect compounds and fluoride ion

Herschlag, Daniel, Jencks, William P.

Журнал:

Journal of the American Chemical Society

Рік:

1990

Мова:

english

Файл:

PDF, 824 KB

english, 1990

Robust design and optimization of retroaldol enzymes

Eric A. Althoff, Ling Wang, Lin Jiang, Lars Giger, Jonathan K. Lassila, Zhizhi Wang, Matthew Smith, Sanjay Hari, Peter Kast, Daniel Herschlag, Donald Hilvert, David Baker

Журнал:

Protein Science

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.13 MB

english, 2012

2′-Fluoro Substituents Can Mimic Native 2′-Hydroxyls within Structured RNA

Marcello Forconi, Jason P. Schwans, Rishi H. Porecha, Raghuvir N. Sengupta, Joseph A. Piccirilli, Daniel Herschlag

Журнал:

Vincent B Chu, Daniel Herschlag

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 382 KB

english, 2011

Unwinding RNA's secrets: advances in the biology, physics, and modeling of complex RNAs

Журнал:

Current Opinion in Structural Biology

Рік:

2008

Мова:

english

Файл:

PDF, 648 KB

english, 2008

Coarse-grained modeling of large RNA molecules with knowledge-based potentials and structural filters

Jonikas, M. A., Radmer, R. J., Laederach, A., Das, R., Pearlman, S., Herschlag, D., Altman, R. B.

Журнал:

RNA

Рік:

2009

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.19 MB

english, 2009

New pathways in folding of the Tetrahymena group I RNA enzyme

Rick Russell, Daniel Herschlag

Журнал:

Rick Russell, Daniel Herschlag

Рік:

1999

Мова:

english

Файл:

PDF, 295 KB

english, 1999

Probing the folding landscape of the Tetrahymena ribozyme: commitment to form the native conformation is late in the folding pathway

Журнал:

Eric J. Sorin, Mark A. Engelhardt, Daniel Herschlag, Vijay S. Pande

Рік:

2001

Мова:

english

Файл:

PDF, 263 KB

english, 2001

RNA simulations: probing hairpin unfolding and the dynamics of a GNRA tetraloop

Журнал:

Рік:

2002

Мова:

english

Файл:

PDF, 1002 KB

english, 2002

Principles of RNA Compaction: Insights from the Equilibrium Folding Pathway of the P4-P6 RNA Domain in Monovalent Cations

Keiji Takamoto, Rhiju Das, Qin He, Sebastian Doniach, Michael Brenowitz, Daniel Herschlag, Mark R. Chance

Журнал:

Рік:

2004

Мова:

english

Файл:

PDF, 829 KB

english, 2004

The Paradoxical Behavior of a Highly Structured Misfolded Intermediate in RNA Folding

Rick Russell, Rhiju Das, Hyejean Suh, Kevin J. Travers, Alain Laederach, Mark A. Engelhardt, Daniel Herschlag

Журнал:

Рік:

2006

Мова:

english

Файл:

PDF, 668 KB

english, 2006

Structural Transitions and Thermodynamics of a Glycine-Dependent Riboswitch from Vibrio cholerae

Jan Lipfert, Rhiju Das, Vincent B. Chu, Madhuri Kudaravalli, Nathan Boyd, Daniel Herschlag, Sebastian Doniach

Журнал:

Jesse G. Zalatan, Timothy D. Fenn, Daniel Herschlag

Рік:

2007

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.49 MB

english, 2007

Comparative Enzymology in the Alkaline Phosphatase Superfamily to Determine the Catalytic Role of an Active-Site Metal Ion

Журнал:

Рік:

2008

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.11 MB

english, 2008

The Ligand-Free State of the TPP Riboswitch: A Partially Folded RNA Structure

Mona Ali, Jan Lipfert, Soenke Seifert, Daniel Herschlag, Sebastian Doniach

Журнал:

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.39 MB

english, 2010

Multiple Unfolding Events during Native Folding of the Tetrahymena Group I Ribozyme

Yaqi Wan, Hyejean Suh, Rick Russell, Daniel Herschlag

Журнал: